Sporofit
Kapang sporofit akan menghasilkan enzim ekstrakurikuler yang memecah molekul kompleks di luar sel menjadi molekul sederhana. Dan golongan ini sangat penting karena ada pula yang merupakan pengurai dalam siklus biogeokimia. Nah, melalui proses tersebut berbagai macam bahan organik dari organisme yang mati akan mengalami penguraian sehingga dunia terlindungi dari tumpukan sampah organik. Jamur juga merupakan organisme limbah utama yang menyebabkan penguraian kayu atau bagian tanaman lainnya. Hal ini karena banyak jamur memiliki enzim yang memecah lignin, senyawa yang membentuk sekitar 25% bagian tanaman berkayu.
Sementara itu, kemampuan kapang sebagai documposer juga dapat menimbulkan permasalahan. Jamur mampu tumbuh dan menyerang berbagai produk industri antara lain kertas, tekstil, kulit, karet, makanan, bahan lensa kaca.
simbion
Kapang dapat membentuk hubungan simbiosis yang saling menguntungkan (mutualisme) dengan tumbuhan. Misalnya saja jamur mikoriza (Rhizopogon sp) yang menginfeksi berbagai akar tanaman sehingga daerah serapan akar tanaman menjadi lebih luas. Mikoriza akan membantu penyerapan unsur P, Zn, Cu dan unsur hara lainnya. Dengan cara ini tanaman akan lebih efektif dalam menyerap unsur hara dan sebaliknya tanaman akan memberikan unsur hara olahan seperti gula dan senyawa organik kepada mikoriza.
Parasit
Jamur dapat bersifat patogen dan membahayakan jika bertindak sebagai parasit. Secara umum penyakit yang disebabkan oleh jamur pada manusia disebut penyakit mikosis. Jamur tertentu dapat menyerang serangga (fugus entomo-patogen) dan telah digunakan sebagai biokontrol terhadap serangga hama. Jamur jenis lain dapat menyerang tanaman dan menyebabkan gangguan produksi pada tanaman kentang dan jagung.
Beberapa jamur yang awalnya tidak bersifat patogen dapat menyebabkan infeksi serius ketika tubuh lemah. Dan infeksi semacam itu disebut infeksi oportunistik dan disebut jamur penyebabnya kapang oportunistik, Rhizopus, Mucos, Dan Aspergillus dapat menyebabkan infeksi paru-paru pada penderita diabetes. Candida albicans sering menyebabkan kandidiasis terutama mereka yang menderita AIDS.
